====== MPI ======
MPI (The Message Passing Interface), conçue en 1993-94, est une norme définissant une bibliothèque de fonctions, utilisable avec les langages C/C++ et Fortran. Elle permet d'exploiter des ordinateurs distants ou multiprocesseur par passage de messages.

====== Principe ======

  * Le programme est écrit dans un langage classique (Fortran, C, C++, etc.) 	
  * chaque processus exécute éventuellement des parties différentes d’un programme 
  * toutes les variables du programme sont privées et résident dans la mémoire locale
  * une donnée est échangée entre deux ou plusieurs processus via un appel à des fonctions particulières

====== Exemples ======
===== Environnement =====

^Exemple C^ Exemple fortran^
|<file C Hello.c>   #include "mpi.h"
   #include <stdio.h>

   int main(argc,argv)
   int argc;
   char *argv[]; {
   int  numtasks, rank, rc; 

   rc = MPI_Init(&argc,&argv);
   if (rc != MPI_SUCCESS) {
     printf ("Error starting MPI program. Terminating.\n");
     MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, rc);
     }

   MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numtasks);
   MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&rank);
   printf ("Number of tasks= %d My rank= %d\n", numtasks,rank);

   /*******  do some work *******/

   MPI_Finalize();
   }</file>|<file Fortran Hello.f>   program simple
   include 'mpif.h'

   integer numtasks, rank, ierr, rc

   call MPI_INIT(ierr)
   if (ierr .ne. MPI_SUCCESS) then
      print *,'Error starting MPI program. Terminating.'
      call MPI_ABORT(MPI_COMM_WORLD, rc, ierr)
   end if

   call MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD, rank, ierr)
   call MPI_COMM_SIZE(MPI_COMM_WORLD, numtasks, ierr)
   print *, 'Number of tasks=',numtasks,' My rank=',rank

C ****** do some work ******

   call MPI_FINALIZE(ierr)

   end</file>|



====== Compilation ======

Il faut tout d'abord charger le module Open MPI (ompi)

<code>
$ module load mpi/openmpi/icc/1.7.5
</code>

**Pour le code C/C++**

<code bash>
$ mpicc hello.c -o hello
</code>

**Pour le code Fortran**

<code bash>
$ mpif90 hello.f -o hello
</code>

<WRAP center round info 60%>

''mpicc'' et ''mpif90'' sont des ''wrappers'' autour du compilateur intel. i.e. le compilateur intel (ifort, icc, ...) sera utilisé pour compiler le programme.

</WRAP>

Afficher les options de compilation par défaut :

<code bash>
$ mpicc --showme
icc -I/Softs/openmpi-intel-1.3.4/include -pthread -L/Softs/openmpi-intel-1.3.4/lib -lmpi -lopen-rte -lopen-pal -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -lutil -shared-intel

</code>


<code bash>
$ mpif90 --showme
ifort -I/Softs/openmpi-intel-1.3.4/include -I/Softs/openmpi-intel-1.3.4/lib -L/Softs/openmpi-intel-1.3.4/lib -lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi -lopen-rte -lopen-pal -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -lutil -shared-intel


</code>


====== Exécution ======

<note important>Il est préférable de tester vos programmes MPI avant de les lancer avec SGE.</note>


Exécution interactive sur la machine de login (mesocluster) :

<code bash>
$module load mpi/openmpi/icc/1.7.5
$ mpirun -np 4 ./monAppli
</code>

Cela exécutera ''monAppli'' en utilisant **4** coeurs sur la machine mesocluster.

===== Exécution avec SGE=====

Plus d'infos [[open_mpi]] et [[sge|Utilisation SGE]] 


====== Ressources ======

  * [[open_mpi_with_java_binding| MPI Java Binding]]
  * Introduction à MPI {{:mpi-1.pdf|}}
  * Message Passing Interface Tutorial https://computing.llnl.gov/tutorials/mpi/