Sumatra

FIXME TODO

Exemple SGE

Se connecter et lancer le calcul depuis : mesologin1.univ-fcomte.fr

sumatra.sge
#!/bin/bash -l
 
#$ -V
#$ -N test_sge
#$ -pe openmp 16  ## on demande 16 coeurs 
#$ -o $JOB_NAME.$JOB_ID.out
 
 
module load bio/sumatra 
 
sumatra -p $NSLOTS gene genomes
usage: sumatra [-l|L|a|n|r|d|x] [-t threshold_value] [-p number of threads] dataset1 [dataset2]