Site de l'université de Franche-Comté
Mesocentre

Logiciels mis à disposition

Les utilisateurs peuvent demander l'installation de logiciels en cas de besoin spécifiques. Dans le cas de logiciels gratuits, la seule condition est la disponibilité des ingénieurs systèmes. Dans le cas de logiciels payants, si vous disposez de la licence (ou de quoi la financer) cela ne pose pas de problème. Sinon il est nécessaire de contacter le mésocentre pour faire une demande ; les demandes sont traitées par le comité scientifique en fonction des financements.

 

La liste complète des logiciels installés avec la documentation [accès restreint]


Système d'exploitation :

  • Le systèmes du cluster est basé sur une distribution Linux Centos 6.5

 

Compilateurs :

  • Compilateurs gratuit standard GNU : gcc, g++, gfortran
  • Intel cluster toolkit (5 jetons ) : icc, icpc, ifort

 

Debuggers et outils d'analyse :

  • GNU gdb, Inetl idb, Intel TraceTool, Scalasca,...

 

Bibliothèques de passage de messages :

  • Open MPI, Inetl MPI, Charm++


Bibliothèques scientifiques :

  • Blas, Lapack, Scalapack, Blacs, PETSc, SLEPc, FFTW,  Intel MKL, Trilinos, GSL,...

Bibliothèques de visualisation et I/O :

  •  Salome, HDF5, HDFView, ParaView

Bibliothèques et outils GPU :

  •  CUDA, OpenCL, JCUDA, JOCL CUSP, Thrust, Magma

Logiciels scientifiques :

  • Abinit
  • Fenics
  • FreeFem++
  • Gamess
  • Gromacs
  • Meep
  • NAMD
  • OpenMX
  • Quantum Espresso
  • LAMMPS
  • R
  • Gate
  • Scilab
  • ...

Logiciels installés sous licence :

  • Matlab, toolboxs (Simulink, Image Processing, Optimization, Signal Processing, Symbolic Math, Statistics, Neural Network, Compiler, PCT)
  • Magma
  • VASP (accès limité à un groupe)
  • MolPro (accès limité à un groupe)
  • Gaussian2009
  • COMSOL Multiphysics, Structural Mechanics Module, MEMS, MICROFLUIDICS
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